Healy tinggal di barat laut London[137] dan mempunyai anjing cane corso yang dinamakan sempena kumpulan black metal Norway Mayhem.[138][139] Pada tahun 2013, Healy dikaitkan secara romantik dengan penyanyi Amerika Halsey.[140][141] Antara 2015 dan 2019, Healy menjalin hubungan dengan model Australia Gabriella Brooks.[142] Dari awal 2020 hingga 2022, Healy menjalin hubungan dengan penyanyi Inggeris FKA Twigs.[143][144]

Healy mengiktiraf diri sebagai heteroseksual,[28][145][146] dan berkata dia tidak tertarik kepada lelaki dalam "cara seksual dan duniawi".[147] Pada tahun 2019, Queerty melaporkan bahawa Healy telah muncul sebagai "penggemar estetik".[148] Namun, Healy mengeluarkan kenyataan di Twitter yang mengkritik penerbitan itu kerana salah tafsir kata-katanya: "Saya tidak keluar sebagai apa-apa. [ … ] Saya tidak bermain permainan dan cuba mengambil ruang yang aneh, saya hanya cuba menjadi sekutu, dan tajuk ini membuatkan saya tidak selesa."[149][150][151] Healy ialah seorang remaja yang "ala geng dan keperempuanan", dan lebih tertarik kepada George Michael, Prince dan Michael Jackson berbanding tokoh kemaskulinan tradisional.[152][153][154] Ibu bapa Healy kedua-duanya berada dalam industri kreatif dan "jenis orang yang saya ingin cita-citakan secara kebetulan merupakan gay": "Saya rasa lebih masuk akal untuk saya menjadi gay atau biseks. Tetapi ia hanya jenis dari mana saya berasal. Saya harap saya tidak pernah mengeksploitasi hal itu ... idea untuk menjadikan diri yang cisgender, kulit putih dan heteroseks lebih menarik dengan menyelaraskan diri mereka dengan budaya itu benar-benar membuatkan saya tersentak."[155]

Healy telah didiagnosis ADHD secara klinikal,[6] dan telah menjalani pembedahan LASIK.[23] Dalam temu bual pada 2022, Healy menyatakan bahawa dirinya sedang menjalani terapi, dan merujuk kepada trauma beriktan "beberapa pengalaman seksual awal yang, apabila [dia] semakin tua, sangat sukar untuk ditangani."[156][157] Healy ialah penagih heroin dalam proses pemulihan,[158][159] dan juga mempunyai masalah dengan penyalahgunaan kokain dan benzodiazepina.[160][16] Pada akhir 2017, dia menghabiskan tujuh minggu di klinik pemulihan dadah pesakit dalam di Barbados,[161][162][163] melalui campur tangan oleh rakan kumpulannya.[28] Dia telah bercakap secara terbuka tentang penggunaan dadahnya: "Saya tidak mahu mengagungkannya kerana ia benar-benar membosankan dan ia sangat berbahaya. Pemikiran untuk menjadi orang muda seperti orang seperti Burroughs kepada saya semasa saya remaja membuatkan saya berasa sakit."[164] Sehingga 2022, Healy masih menghisap ganja.[165][101]